报告题目:混合池方法快速高效地定位和寻找性状关联基因
Efficient Bulked Approaches to Map Trait-associated Genomic Variation
报告内容简介:下一代测序技术的发展给许多生物学研究领域提供了强大的研究工具。在下一代测序平台的基础上,众多分支应用得到迅速发展,帮助解决了相关的生物学问题。本报告将通过介绍几个研究实例,探讨如何有效地利用下一代测序技术,包括如何利用测序快速定位植物性状基因,和如何利用长序列测序完整地组装基因组。首先,我们将以玉米glossy基因克隆为例,介绍通过RNA测序快速有效地定位单基因控制的性状基因(BSR-Seq)的方法。本报告还以玉米的细菌疾病Goss’s wilt为例,利用极端混合池全基因组关联分析(XP-GWAS)和极端混合池基因拷贝数关联分析(XP-CNV)进行复杂性状遗传解析 。此外,我们还将简单讨论Goss’s wilt等病原菌的基因组测序和组装。
报告人:刘三震(Kansas State University堪萨斯州立大学)
主办单位:林木遗传育种国家重点实验室
时间:2017年6月5日(星期一)8:50
地点:林学院主西104
参加人:全体师生
报告人简介:刘三震博士现任美国堪萨斯州立大学(Kansas State University)教授。刘博士于1997和2000年从厦门大学分别获得学士和硕士学位,2010年从美国Iowa 大学获得遗传学博士学位。从2010 到2013年在Iowa大学做博士后研究。从2013 年到现在,在堪萨斯州立大学植物病理系任教授。
主要代表性学术论文:刘教授曾在PloS Genetics, Plant Journal, Science, Nature Communication 等杂志发表SCI论文30 余篇。主要研究领域包括(1)玉米和小麦的抗病性;(2)基因组变异对表现型影响;(3)mRNA可变剪切;(4)用测序法对基因组分型。刘博士开发了混合池快速高效定位和寻找与性状有关的调控基因。